A bifidobaktérium hatékonyan gátolhatja a közös romlást és az alacsony- hőmérsékletű baktériumokat. Antibakteriális hatása elsősorban a táplálkozási és tapadási helyek versenyén, az antibakteriális anyagok előállításán és a test immunitásának megerősítésén keresztül. Ez hatással van a bél patogén baktériumok adhéziójára és szaporodására. Az antagonizmushoz és a betegség patogenezisének blokkolásához. A bifidobaktériumok által termelt antibakteriális anyagok elsősorban szerves savak, bakteriocinok, bakteriocinok és más antibakteriális anyagok.
Az illékony rövid - lánc zsírsavak, például tejsav és ecetsav, amelyek a bifidobaktériumok metabolitjai, növelik a hidrogén -ionok koncentrációját a környezetben, amely magasabb, mint a hidrogénionok koncentrációja a patogén baktériumok sejtjeiben. A hidrogénionok behatolnak a patogén baktériumok sejtjeibe, hogy a citoplazma savanyítása befolyásolja annak növekedését, és még a patogén baktériumokat is inaktiválja az antibakteriális hatások elérése érdekében.
A tanulmányok kimutatták, hogy a bifidobaktériumok fermentációjának levese nyilvánvaló antibakteriális hatással van in vitro, és az alacsony pH fontos feltétele annak antibakteriális hatása szempontjából. Ezenkívül egyes bifidobaktériumok metabolizálódhatnak, hogy riboszómákkal szintetizált protein előállítsa az antibakteriális hatásokkal, úgynevezett bakteriális toxinokat, amelyek gátolhatják más patogén baktériumok növekedését.